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[其他] 对接图像是否需要旋转

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发表于 2012-10-25 14:55:14 | 显示全部楼层 |阅读模式

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各位大大,请见图一和图二。图一是对接后图像,但是ligand所在的位置看不清楚,有些部位被挡住了。现在的问题是(1)发文章的时候,是否需要将对接后的复合体旋转,将ligand结合处突出出来,如图2所做。这种做法可取吗?还是不允许的?(2)如果整体图像不能旋转,空间结构不能变化,如果将对接处框出来,然后放大,这部位是否可以旋转啊?呵呵,通常这种作图注意有哪些啊? 网上搜的都比较泛泛,所以想请具体分析。
2B4X-white.png
2B4X-del ligand water and hemeta.png
 楼主| 发表于 2012-10-25 15:26:03 | 显示全部楼层
刚看到中大-活性小肽的DSV教程,很有帮助。结合位点图放大图要按照小肽介绍的方法做了。
发表于 2012-10-25 15:28:32 | 显示全部楼层
(1) 如果你要表示蛋白的整体,并且让读者看到配体分子作用于蛋白的什么地方,整体作图是可以的。
(2) 如果采用整体图+局部放大,是比较好的效果,局部放大是可以旋转蛋白的,局部图主要是展示配体分子和氨基酸残基的作用。
总的来说,作图是根据你要表达的意思定的!
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