关于分子对接的一点问题要请教一下大家。

lozlang · 发表于 2018-1-20 16:06:14

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刚接触分子对接有点问题想要问问大家，希望大家能指导我一下。
1、我是用vina来做对接的，对接盒子的中心位点怎么设置呢，是以大分子文件中的配体为中心吗？如果下载来的大分子不包含配体小分子的话怎么办？以大分子的中心作为盒子中心吗？
2、对接之后还需要知道配体与受体的结合位点以及该处氨基酸的名称，我是用VMD来观察结果的，可是弄不出想要的结合位点等的信息，是我操作有误了吗？
谢谢大家了

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