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[AutoDock&Vina] 关于分子对接的一点问题要请教一下大家。

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发表于 2018-1-20 16:06:14 | 显示全部楼层 |阅读模式

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刚接触分子对接有点问题想要问问大家,希望大家能指导我一下。
1、我是用vina来做对接的,对接盒子的中心位点怎么设置呢,是以大分子文件中的配体为中心吗?如果下载来的大分子不包含配体小分子的话怎么办?以大分子的中心作为盒子中心吗?
2、对接之后还需要知道配体与受体的结合位点以及该处氨基酸的名称,我是用VMD来观察结果的,可是弄不出想要的结合位点等的信息,是我操作有误了吗?
谢谢大家了
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