生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 4624|回复: 3

[Pymol] PyMOL新手学习

[复制链接]
发表于 2016-6-7 19:13:28 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
各位好,我想学习一下PyMOL这个软件,按照教程试了一下,打开了一个蛋白质分子2vl0。在命令栏输入label all, chains之后,出现了如下提示:
Traceback (most recent call last):
  File "", line 1, in <module>
    #!/bin/sh
NameError: name 'chains' is not defined
Label: labelled 0 atoms.
请问是怎么回事?希望高手指点一下。谢谢!
发表于 2016-6-8 10:34:33 | 显示全部楼层
NameError: name 'chains' is not defined  这个提示你 没有chains 这个东西,说明你的命令是错误的,请仔细查看pymol命令格式和各个部分代表的意义。
 楼主| 发表于 2016-6-8 12:32:30 | 显示全部楼层
川大-灰太狼 发表于 2016-6-8 10:34
NameError: name 'chains' is not defined  这个提示你 没有chains 这个东西,说明你的命令是错误的,请仔 ...

我是个新手,什么也不懂。我是在完全按照网上下载的学习笔记重复的呀。
 楼主| 发表于 2016-6-9 13:57:13 | 显示全部楼层
川大-灰太狼 发表于 2016-6-8 17:09
给你举个例子吧:label all, A  这样的才是标记A链。

那对于一个新的蛋白质并不知道它有几条连,想通过软件标记出所有的链呢?
您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3 )

GMT+8, 2024-12-25 14:50 , Processed in 0.070267 second(s), 19 queries .

Powered by Discuz! X3.4

Copyright © 2001-2020, Tencent Cloud.

快速回复 返回顶部 返回列表