DNA\protein多序列比对利器-MAFFT

浙农林—老张 · 发表于 2012-11-27 10:52:56

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本帖最后由浙农林—老张于 2012-11-27 11:09 编辑

http://mafft.cbrc.jp/alignment/software/
MAFFT is a multiple sequence alignment program for unix-like operating systems. It offers a range of multiple alignment methods, L-INS-i (accurate; for alignment of <∼200 sequences), FFT-NS-2 (fast; for alignment of <∼10,000 sequences), etc. 200条以内序列的精确比对，10,000条序列的快速比对，呵呵，序列比对的数量这个比其他软件有优势哈哈。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2923890/

浙农林—老张 · 发表于 2012-11-27 11:02:06

未仔细研究，没有发现其图形参数设置的地方，难道又是mega做的？有空的站友能详细研究后给出点建议。

浙农林—老张 · 发表于 2012-11-27 11:18:44

原来是结合FastTree http://meta.microbesonline.org/fasttree/#Install 做的。

川大-灰太狼 · 发表于 2012-11-27 12:06:13

呵呵虽然不懂，但是很漂亮的图！支持下老张哥发的资源。

西大-song · 发表于 2012-12-4 00:07:05

一般大规模深度测序后这样的图比较多

lemon19920102 · 发表于 2016-11-1 22:04:51

谢谢分享

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