GMX在ubuntu系统下的安装，小编个人的安装经验仅供参考！

prince好先森

  首先  我是系统管理员下面的一个子用户，所以没有管理员权限，安装过程有点麻烦，但是安装开源的软件都可以在我自己目录下面！  不喜勿喷！
1-安装cmake
    去cmake官网下载 cmake-3.3.1.tar.gz
    tar -xvf cmake-3.3.1.tar.gz
    cd cmake
    cd cmake-3.3.1
    这一步是关键 ./bootstrap --prefix=/路径/cmake3.3.1
    make
    make install
    设置cmake环境变量    去修改bashrc文件 （或者在用户bin里 建一个文件 放入cmake的路径 把文件设置可执行  这个方法不正规）
    运行cmake看看有没有装好
2-gromacs的安装
  去官网下载gromacs-5.1.tar.gz
  tar -xvf gromacs-5.1.tar.gz
  cd gromacs-5.1
  mkdir build
  cd build
  cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DGMX_SIMD=None -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/路径/gmx/gromacs-5.1
  make
  make install
  source  /路径/gromacs-5.1/bin/GMXRC
  GMXRC是配置文件，可在bashrc里面加入环境变量  vi .bashrc 然后 source  /路径/gromacs-5.1/bin/GMXRC  source .bashrc即可
注意：-DGMX_SIMD=None  这里做了改变，安装对于不同的电脑，官网的还是需要自己去探索，不是一成不变的安装过程
以上是小编的安装新得  希望对新手小白有所帮助！

greatzdl

请问-DGMX_SIMD=None 这个改变是什么意思，如此设置对我的编译结果会有什么影响呢？希望能得到您的回复。我也是小白

prince好先森

greatzdl 发表于 2015-9-23 14:53
请问-DGMX_SIMD=None 这个改变是什么意思，如此设置对我的编译结果会有什么影响呢？希望能得到您的回复。我 ...

greatzdl   你怎么又跑过来了？上个帖子你还没闹够？

greatzdl

prince好先森 发表于 2015-9-24 08:49
greatzdl   你怎么又跑过来了？上个帖子你还没闹够？

互相交流嘛
上个帖子最后的你的留言我没看到，然后帖子就没有了。
我感到很遗憾。
大家都是小白，互相交流嘛

prince好先森

您是大神 我是小白 好不！你要是闲着蛋疼，你去别的地方逛逛吧！

greatzdl

prince好先森 发表于 2015-9-24 14:42
您是大神 我是小白 好不！你要是闲着蛋疼，你去别的地方逛逛吧！

你说话好难听啊，
你这态度不是学习交流的态度啊
感觉你这样做 是在给论坛抹黑
请你回答一下我的问题吧？
请问-DGMX_SIMD=None 这个改变是什么意思，如此设置对我的编译结果会有什么影响呢？希望能得到您的回复。我也是小白

谢谢