生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 5591|回复: 1

[AMBER] 用antechamber时打不开文件在rpdb()怎么破求解!

[复制链接]
发表于 2014-11-17 21:37:48 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
现在还在按照官网的tutorial做的菜鸟,遇到了一点麻烦。当我敲入 antechamber -i sustiva_new.pdb -fi pdb -o sustiva.mol2 -fo mol2 -c bcc -s 2后,却出现了 cannot open the input file:sustiva_new.pdb in rpdb(),exit的错误。
求解,rpdb是个啥


 楼主| 发表于 2014-11-18 21:23:56 | 显示全部楼层
viger87 发表于 2014-11-18 12:04
1.确保你的文件可读,输入:ls -l sustiva_new.pdb  (看看结果)
2.确保你的sustiva_new.pdb 文件没问题
3 ...

太感谢了!文件是nogourp,不是我用户名下的。百度了chown的用法,修改了文件权限现在可以了!好爱你啊!!!
另,再厚颜无耻地问一下下修补antechamber补丁用什么command?
您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3 )

GMT+8, 2024-12-26 01:48 , Processed in 0.045882 second(s), 19 queries .

Powered by Discuz! X3.4

Copyright © 2001-2020, Tencent Cloud.

快速回复 返回顶部 返回列表