临江仙 发表于 2014-1-3 18:54:45

未央尊 发表于 2014-1-3 12:18 static/image/common/back.gif
很不错，就是没有这个模块没法弄

:lol，等你发paper了和你们老板申请下，嘿嘿

雨枫 发表于 2014-1-5 10:30:40

临江仙 发表于 2014-1-3 18:53 static/image/common/back.gif
雨枫姐，md_run.macro默认的是水相的参数，如果想一键MD，还需要自己另外修改正确，嘿嘿 ...

嗯，我也注意到你用的是非水相了。哈哈

川大-灰太狼 发表于 2014-1-5 11:12:56

雨枫 发表于 2014-1-5 10:30 static/image/common/back.gif
嗯，我也注意到你用的是非水相了。哈哈

呵呵 小珍，小仙用的是混合体系，有机溶剂里的MD。这个在Yasara里面是很容易的做，自动识别立场，非常人性化。

雨枫 发表于 2014-1-6 14:55:07

川大-灰太狼 发表于 2014-1-5 11:12 static/image/common/back.gif
呵呵 小珍，小仙用的是混合体系，有机溶剂里的MD。这个在Yasara里面是很容易的做，自动识别立场，非常人 ...

嗯，我在试着运行水相中的MD，更是人性化啊，哈哈

川大-灰太狼 发表于 2014-1-6 15:28:21

雨枫 发表于 2014-1-6 14:55 static/image/common/back.gif
嗯，我在试着运行水相中的MD，更是人性化啊，哈哈

呵呵 小珍，水相的直接就是一键MD，非常方便！不需要准备什么配体小分子力场，自动识别。

sangerjay 发表于 2014-12-9 00:06:59

下了，在学习中
:)

kittycui 发表于 2016-6-22 16:59:18

yasara除了图形界面没有文字界面进行批处理Md么？如果需要做的md多的话，难道要一个一个做前处理？
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查看完整版本: YASARA混合体系的分子动力学教程