原创UCSF Chimera绘制配体-受体三维图

墨竹晓风 · 发表于 2013-12-17 17:43:55

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本帖最后由墨竹晓风于 2013-12-19 11:34 编辑

UCSF Chimera是个很赞的软件，由著名的The University of California, San Francisco (UCSF)出品。原创作品，转载请标明出处

经过笔者摸索，chimera1.8.1也可以做出漂亮的图。做了一个简要的教程请大家指教！

写了整个一下午，感谢大工-阿里巴巴。支持原创劳动，谢谢
欢迎交流

其一

其二

墨竹晓风 · 发表于 2013-12-23 11:43:39

本帖最后由墨竹晓风于 2013-12-23 11:51 编辑

qian430 发表于 2013-12-21 15:16

登录/注册后可看大图

我用chimera1.6做了一下，一样的操作（选中配体----findhbond）为啥给出的氢键不只是配体和残基的，连蛋白 ...

我这里正常啊，默认的状态下include 这两项是选中的，需要设置全都不选中。
和qian讨论了下，上述设置不行的话，那么再勾选上only find H-bond。
有可能是软件版本的关系

南湖的虫 · 发表于 2015-7-24 10:11:35

您好，最近在用chimera处理docking后的l配体受体复合物，请问配体和受体中的金属离子（Zn)有作用形成配位键，在chimera中怎么显示？谢谢

prince好先森 · 发表于 2015-7-10 09:56:21

chimera ，貌似也很火希望能有一个中文教程，对于我们这种菜鸟将是一个福利啊

大工-阿里巴巴 · 发表于 2013-12-17 19:01:53

支持墨墨~下下来学习一下！

尐狐 · 发表于 2013-12-17 20:14:32

支持原创&分享~~~~！

尐狐 · 发表于 2013-12-17 20:14:54

支持原创&分享~~~~！

临江仙 · 发表于 2013-12-17 20:31:43

墨兄大作哈

xufund · 发表于 2013-12-17 20:44:51

支持原创啊。谢谢

Valar_Morghulis · 发表于 2013-12-17 23:10:23

{:soso_e179:}

eming · 发表于 2013-12-18 04:04:04

支持使用chimera，
pymol有时候有种审美疲劳

hydrolase · 发表于 2013-12-18 08:39:40

{:soso_e179:}

0703114邓 · 发表于 2013-12-18 09:15:48

支持，学习

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[Pymol] 原创UCSF Chimera绘制配体-受体三维图