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[原创] 原创UCSF Chimera绘制配体-受体三维图

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发表于 2013-12-17 17:43:55 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本帖最后由 墨竹晓风 于 2013-12-19 11:34 编辑

UCSF Chimera是个很赞的软件,由著名的The University of California, San Francisco (UCSF)出品。原创作品,转载请标明出处
经过笔者摸索,chimera1.8.1也可以做出漂亮的图。做了一个简要的教程请大家指教!

写了整个一下午,感谢大工-阿里巴巴。支持原创劳动,谢谢
欢迎交流

其一
2.jpg

其二
1.jpg

2013-12-17-墨竹晓风-UCSF chimera绘制三维图.pdf

1019.28 KB, 下载次数: 568

售价: 2 金币  [记录]

发表于 2013-12-21 15:16:35 | 显示全部楼层
我用chimera1.6做了一下,一样的操作(选中配体----findhbond)为啥给出的氢键不只是配体和残基的,连蛋白内部的氢键也给出了。好多好多氢键呢? @`(9SEHM0E~LHM0Q{G7OVJX.jpg
 楼主| 发表于 2013-12-23 11:43:39 | 显示全部楼层
本帖最后由 墨竹晓风 于 2013-12-23 11:51 编辑

我这里正常啊,默认的状态下include 这两项是选中的,需要设置全都不选中。
和qian讨论了下,上述设置不行的话,那么再勾选上only find H-bond。
有可能是软件版本的关系
发表于 2015-7-24 10:11:35 | 显示全部楼层
您好,最近在用chimera处理docking后的l配体受体复合物,请问配体和受体中的金属离子(Zn)有作用形成配位键,在chimera中怎么显示?谢谢
发表于 2015-7-10 09:56:21 | 显示全部楼层
chimera ,貌似也很火 希望能有一个中文教程,对于我们这种菜鸟  将是一个福利啊
发表于 2013-12-17 19:01:53 | 显示全部楼层
支持墨墨~下下来学习一下!
发表于 2013-12-17 20:14:32 | 显示全部楼层
支持原创&分享~~~~!
发表于 2013-12-17 20:14:54 | 显示全部楼层
支持原创&分享~~~~!
发表于 2013-12-17 20:31:43 | 显示全部楼层
墨兄大作哈
发表于 2013-12-17 20:44:51 | 显示全部楼层
支持原创啊。谢谢
发表于 2013-12-17 23:10:23 | 显示全部楼层
{:soso_e179:}
发表于 2013-12-18 04:04:04 | 显示全部楼层
支持使用chimera,
pymol有时候有种审美疲劳
发表于 2013-12-18 08:39:40 | 显示全部楼层
{:soso_e179:}
发表于 2013-12-18 09:15:48 | 显示全部楼层
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