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[AutoDock&Vina] 要如何將docking結果存成一個檔

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发表于 2013-12-4 00:41:28 | 显示全部楼层 |阅读模式

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當我用PYRX做完docking後,要如何存成一個檔,也就是用pymol打開後看的到配體在蛋白質上的結果
发表于 2013-12-4 16:06:41 | 显示全部楼层
请问你用的是 autodock还是vina对接的呢?
 楼主| 发表于 2013-12-8 13:05:42 | 显示全部楼层
发表于 2013-12-11 08:56:31 | 显示全部楼层
flacon 发表于 2013-12-8 13:05
我做的是autodock的對接

Pyrx不能把蛋白和配体存为一个文件,所以你需要自己单独处理,比如把对接后的配体保存为sdf格式,然后用pymol打开蛋白,再导入配体就行了。接着就可以作图了!
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