关于autodock盒子的设置问题

kaliduomu · 发表于 2013-11-22 10:53:58

马上注册，结交更多好友，下载更多分子模拟资源。

您需要登录才可以下载或查看，没有帐号？我想注册

x

我在做autodock时，想先做个blind dock,但是我把number of points都选到最大126了，还是无法把真个蛋白包进去，这时我修改spacing来增大盒子的体积。增大spacing是不是会降低对接的精度哈？另外我发现盒子不能旋转，只能平动，这样的话我就不能把蛋白直径最大的部分放在盒子的对角线上。求大神指导如何处理蛋白太大，盒子包不住的问题。

墨竹晓风 · 发表于 2013-11-22 16:50:45

只包裹活性位点即可. blind docking的话,用vina做,参数自己写

kaliduomu · 发表于 2013-11-22 17:19:25

后就是vina没有126的限制是吗？

帐号		自动登录	找回密码
密码			我想注册

[AutoDock&Vina] 关于autodock盒子的设置问题

马上注册，结交更多好友，下载更多分子模拟资源。