小分子的能量域问题

爱笑的格格 · 发表于 2013-9-9 22:17:41

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DS的小分子构象产生都有一个能量域的选项，默认设置为20kcal/mol，突然想了解下分子的最低能量和活性构象之间的能量差有一个范围吗？坛里的牛牛们有晓得的吗？{:soso_e121:}

川大-灰太狼 · 发表于 2013-9-11 17:16:04

“分子的最低能量和活性构象之间的能量差有一个范围吗？”

一般来说活性构象接近最低能量，但没有一个具体的范围值。因为各种分子的结构不一，还有可能存在几种最低能量或者活性构象，所以这样的无法去定义一个值的范围。但你可以根据玻尔兹曼分布，估计下分子构象的分布。

爱笑的格格 · 发表于 2013-9-11 19:25:51

受教了，谢谢灰太狼的解答{:soso_e160:}

爱笑的格格 · 发表于 2013-9-11 19:26:19

川大-灰太狼发表于 2013-9-11 17:16

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“分子的最低能量和活性构象之间的能量差有一个范围吗？”

一般来说活性构象接近最低能量，但没有一个具体 ...

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