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[其他] 柔性对接问题

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发表于 2013-8-14 16:02:26 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本帖最后由 爱笑的格格 于 2013-8-16 15:27 编辑

各位大大,设置柔性对接的时候van der Waals scaling 该怎么理解呢?{:soso_e160:}
发表于 2013-8-17 06:13:16 | 显示全部楼层

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This factor scales the van der waals radii and soften the van der waals repulsive interaction, which tolerates the local collisions in the flexible docking. Basically, the smaller this factor (I assume it is between 0 and 1), more "soften" of the van der waals repulsive interaction.
 楼主| 发表于 2013-8-21 14:14:50 | 显示全部楼层

嗯,三克油哦,那么你能再讲讲设置的时候这factor0-1该如何把握呢?
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