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[Ligplot] 导入PDB文件一直报错

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发表于 2021-7-20 17:18:15 | 显示全部楼层 |阅读模式

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试着将对接后的pdb文件导入ligplot,但文件一直报错,使用pymol打开pdb文件没有问题。 QQ图片20210720171655.png IL1B-CS.zip (47.1 KB, 下载次数: 1)
发表于 2021-7-20 17:29:37 | 显示全部楼层
错误信息:原子的坐标文件没有找到,所以让Plot很为难:)
 楼主| 发表于 2021-7-20 17:32:38 来自手机 | 显示全部楼层
川大-灰太狼 发表于 2021-7-20 17:29
错误信息:原子的坐标文件没有找到,所以让Plot很为难:)

原子文件用pymol可以正常打开啊,
来自: 微社区
发表于 2021-7-21 12:00:45 | 显示全部楼层
小郭0815 发表于 2021-7-20 17:32
原子文件用pymol可以正常打开啊,

可以试试去掉氢原子后,用ligplot打开。
发表于 2021-7-21 14:05:43 | 显示全部楼层
小郭0815 发表于 2021-7-20 17:32
原子文件用pymol可以正常打开啊,

http://bioms.org/forum.php?mod=v ... p;highlight=ligplus   ligplus的安装与使用(显示配体-受体2维相互作用图)或许可以参考。
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