导入PDB文件一直报错

小郭0815 · 发表于 2021-7-20 17:18:15

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试着将对接后的pdb文件导入ligplot,但文件一直报错，使用pymol打开pdb文件没有问题。 QQ图片20210720171655.png

IL1B-CS.zip (47.1 KB, 下载次数: 1)

川大-灰太狼 · 发表于 2021-7-20 17:29:37

错误信息：原子的坐标文件没有找到，所以让Plot很为难：）

小郭0815 · 发表于 2021-7-20 17:32:38

川大-灰太狼发表于 2021-7-20 17:29
错误信息：原子的坐标文件没有找到，所以让Plot很为难：）

原子文件用pymol可以正常打开啊，
来自: 微社区

川大-灰太狼 · 发表于 2021-7-21 12:00:45

小郭0815 发表于 2021-7-20 17:32
原子文件用pymol可以正常打开啊，

可以试试去掉氢原子后，用ligplot打开。

川大-灰太狼 · 发表于 2021-7-21 14:05:43

小郭0815 发表于 2021-7-20 17:32
原子文件用pymol可以正常打开啊，

http://bioms.org/forum.php?mod=v ... p;highlight=ligplus ligplus的安装与使用（显示配体-受体2维相互作用图）或许可以参考。

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[Ligplot] 导入PDB文件一直报错