Gaussian09的安装方法和运行，如何做，请帮助！

SYPHU_me

是CentOS6.3系统
下载的是G09.B01.LINUX_E64-930X.tgz文件，解压到的目录是/usr/Gaussian09E64（g09文件夹在这个目录下），并在g09下面建立了scratch文件夹。
在根目录下打开.bascrc
环境变量设置如下：

#Setting Gaussian 09

export g09root=/usr/Gaussian09E64

export GAUSS_EXEDIR=$g09root/g09

export GAUSS_SCRDIR=$g09root/g09/scratch

export LD_LIBRARY_PATH=$g09root

source $g09root/g09/bsd/g09.profile

保存并退出后，source .bashrc
然后执行命令g09，显示Entering Gaussian system, Link 0=g09(PS:其实没什么反应)

请高手指点一下，非常感谢！

SYPHU_me

viger87 发表于 2012-10-24 20:08

                               
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编好输入文件，如：1.com
然后输入：g09 1.com &
就可以了

菜鸟一枚，真心不懂，如有时间能详细说下吗？谢谢
另外，Gaussian在linux下有图形界面吗？

川大-灰太狼

Gaussian View 就是图形界面。可以观看结果和准备计算文件！

kangsgo

viger87 发表于 2012-10-24 20:08
编好输入文件，如：1.com
然后输入：g09 1.com &
就可以了

请问这个要怎么终止呢~参数设置错了````````

kangsgo

viger87 发表于 2015-11-13 20:39
直接kill了gaussian的进程就行了。下面是step by step教程：
1. 终端输入：ps x
2.看到gaussian进程号， ...

好的，非常感谢~

我看到你也发了gromcas安装教程，我还想请问一下：

我用gromacs 做分子动力学，用http://davapc1.bioch.dundee.ac.uk/cgi-bin/prodrg/run.html  这个网址算出的小分子配体top文件的电荷是错误的。
所以又用了高斯计算，但是高斯中是包含配体小分子的非极性氢的，但是此网站计算的电荷不包括，（高斯计算的小分子配体的非极性氢的电荷如何处理？）请问这个问题，怎么解决？？