生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 12048|回复: 4

[Gaussian] Gaussian09的安装方法和运行,如何做,请帮助!

[复制链接]
发表于 2012-10-24 17:43:33 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
是CentOS6.3系统
下载的是G09.B01.LINUX_E64-930X.tgz文件,解压到的目录是
/usr/Gaussian09E64(g09文件夹在这个目录下),并在g09下面建立了scratch文件夹。
在根目录下打开.bascrc
环境变量设置如下:

#Setting Gaussian 09
export g09root=/usr/Gaussian09E64
export GAUSS_EXEDIR=$g09root/g09
export GAUSS_SCRDIR=$g09root/g09/scratch
export LD_LIBRARY_PATH=$g09root
source $g09root/g09/bsd/g09.profile
保存并退出后,source .bashrc
然后执行命令g09,显示Entering Gaussian system, Link 0=g09(PS:其实没什么反应)

请高手指点一下,非常感谢!

 楼主| 发表于 2012-10-25 09:07:39 | 显示全部楼层

菜鸟一枚,真心不懂,如有时间能详细说下吗?谢谢
另外,Gaussian在linux下有图形界面吗?
发表于 2012-10-25 09:53:40 | 显示全部楼层
Gaussian View 就是图形界面。可以观看结果和准备计算文件!
发表于 2015-11-10 12:24:33 | 显示全部楼层
viger87 发表于 2012-10-24 20:08
编好输入文件,如:1.com
然后输入:g09 1.com &
就可以了

请问这个要怎么终止呢~参数设置错了````````
发表于 2015-11-15 13:45:27 | 显示全部楼层
viger87 发表于 2015-11-13 20:39
直接kill了gaussian的进程就行了。下面是step by step教程:
1. 终端输入:ps x
2.看到gaussian进程号, ...

好的,非常感谢~

我看到你也发了gromcas安装教程,我还想请问一下:

我用gromacs 做分子动力学,用http://davapc1.bioch.dundee.ac.uk/cgi-bin/prodrg/run.html  这个网址算出的小分子配体top文件的电荷是错误的。
所以又用了高斯计算,但是高斯中是包含配体小分子的非极性氢的,但是此网站计算的电荷不包括,(高斯计算的小分子配体的非极性氢的电荷如何处理?)请问这个问题,怎么解决??
您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3 )

GMT+8, 2024-3-29 03:14 , Processed in 0.056029 second(s), 19 queries .

Powered by Discuz! X3.4

Copyright © 2001-2020, Tencent Cloud.

快速回复 返回顶部 返回列表