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[AutoDock&Vina] 关于Autodock结果的评判

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发表于 2020-9-25 09:50:54 | 显示全部楼层 |阅读模式

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有碰到结合能最低结构,但不是分簇中占比最高的
感觉一般还是选择能量最低的结构?有些文献簇中最多的和能量最低的是同一个当然就不存在这个问题
之前以为是对接的数量不够导致,后来将参数设大了,跑了好久,结果还是类似的

另外重新分簇reclustering以2.0A分出来和直接对接完成的簇会完全不一样是什么原因?
发表于 2020-9-27 11:40:47 | 显示全部楼层
不知道你的参数是多少,能量最低的分子有可能是极值,个人经验一般选簇最多的分子。
发表于 5 天前 | 显示全部楼层
选簇最多的能量最低?
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