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[AutoDock&Vina] AntoDock对接结果中的结合能

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发表于 2020-4-12 20:19:47 | 显示全部楼层 |阅读模式

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想向各位前辈请教一下,AntoDock对接结果中的结合能是不是一般为负值,且越小越好呢?如果对接结果的结合能都为正值的话,这代表着什么意思呢?就是AutoDock对接结果的结合能正负代表着什么意思呢?
发表于 2020-4-22 16:37:33 | 显示全部楼层
对接结果-结合能反应你两个分子对接结合的可能性,,,负值代表二者更容易结合,正值代表不易结合;简单来说,结合能越小越好,表明这个pose的状态下,这两个分子在自然状态下结合释放能量即更容易结合(当然,需要实验进一步验证)
个人理解,你可以参考一下,,我用DS多一些,但感觉原理是一样的。
发表于 2020-4-23 09:11:02 | 显示全部楼层
越负越好,最好比-9还小。都是正的说明结合很差
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