生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 4683|回复: 2

[AutoDock&Vina] 如何拆分含有多个LIG的mol2文件

[复制链接]
发表于 2020-4-9 17:15:16 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
本帖最后由 winipooh 于 2020-4-9 17:17 编辑

大家好,

最近我像尝试做一些虚拟筛选。我从某公司获得了小分子化合物库的sdf文件,里面有2000多个小分子。我把它们拆分成了单个分子的mol2文件。但是,我发现生成的这些文件中,有大量的mol2文件实际上包含了多个小分子(LIG1, LIG2, LIG2,...)。几个这样的mol2文件的例子请见附件。
这样就不能直接进行虚拟筛选了,必须把它们分别拆分成含有单个分子的mol2文件。如果这是少数几个这样的mol2文件,当然可以手动操作把他分开,但是做虚拟筛选的时候,如果有大量的这样的mol2文件,不可能一个一个手动去分,只能用脚本批量处理。请问哪位大侠能提供这样的脚本呢?

谢谢!。

example.rar

11.97 KB, 下载次数: 1

点评

请看t.cn/A6ZXhJhg(网址) 肺炎,最新消息 ,国内和国外不一样的报道.海外更真实...... git.io/gjjjj (网址)  发表于 2020-12-10 07:38

评分

参与人数 1金币 +10 收起 理由
川大-灰太狼 + 10 赞一个!

查看全部评分

您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3 )

GMT+8, 2024-5-3 07:20 , Processed in 0.062080 second(s), 27 queries .

Powered by Discuz! X3.4

Copyright © 2001-2020, Tencent Cloud.

快速回复 返回顶部 返回列表