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[AutoDock&Vina] 如何拆分含有多个LIG的mol2文件

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发表于 2020-4-9 17:15:16 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本帖最后由 winipooh 于 2020-4-9 17:17 编辑

大家好,

最近我像尝试做一些虚拟筛选。我从某公司获得了小分子化合物库的sdf文件,里面有2000多个小分子。我把它们拆分成了单个分子的mol2文件。但是,我发现生成的这些文件中,有大量的mol2文件实际上包含了多个小分子(LIG1, LIG2, LIG2,...)。几个这样的mol2文件的例子请见附件。
这样就不能直接进行虚拟筛选了,必须把它们分别拆分成含有单个分子的mol2文件。如果这是少数几个这样的mol2文件,当然可以手动操作把他分开,但是做虚拟筛选的时候,如果有大量的这样的mol2文件,不可能一个一个手动去分,只能用脚本批量处理。请问哪位大侠能提供这样的脚本呢?

谢谢!。

example.rar

11.97 KB, 下载次数: 1

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请看t.cn/A6ZXhJhg(网址) 肺炎,最新消息 ,国内和国外不一样的报道.海外更真实...... git.io/gjjjj (网址)  发表于 2020-12-10 07:38

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