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[Pymol] 电子密度图形状不均匀圆滑

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发表于 2020-1-28 12:52:11 | 显示全部楼层 |阅读模式

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在PDB网站上下载了蛋白的fo-fc电子密度图,设置了选定残基(ss1)的电子密度,命令如下:PyMOL> isomesh mesh1, 2fofc.map, 1.0, ss1, carve=1.6



参见出处:
http://bioms.org/thread-822-1-1.html

其他设置如下:level 0.0

但是生成的电子密度图不是像例子里面那么均匀圆滑,看起来就像有破洞的渔网。
png_example.png
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