如何模拟一个蛋白质发生磷酸化修饰的结构？

猴丫丫

各位大佬，我是这个方面的小萌新，想知道一个蛋白某个位点发生磷酸化修饰以后与底物结合能力的变化，能不能实现呢？如果可以实现应该具体怎么做呢？希望大佬们伸出援手，感激不尽！

川大-灰太狼

完全可以实现的，只是磷酸化的氨基酸，要使用新的立场来进行分子动力学模拟，相对一般的标准氨基酸会复杂一点。