各位大神，建模之后这是什么鬼……

Canon · 发表于 2018-12-19 16:47:05

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各位大神，最近在用Modeller建模，我现在做的这个蛋白是个四聚体，但是，之前建模都是建的单体，结果是正常的，最近想做一下二聚体的建模，用之前的PDB模型准备了一个二聚体结构，ali文件内容是：>P1;TvLDH
sequence:TvLDH:::::::0.00: 0.00
MASTAIVTN-------------RPPGMPELE/
MASTAIVTN-------------RPPGMPELE*
可是建模结果确实这个鬼样子，哪位大神帮忙指点一下，谢谢！

小崔 · 发表于 2018-12-21 08:05:09

那些鬼地方可能是因为这部分序列没有模板导致的

Canon · 发表于 2019-1-2 20:25:03

小崔发表于 2018-12-21 08:05
那些鬼地方可能是因为这部分序列没有模板导致的

已经解决了，谢谢~

娜娜 · 发表于 2020-1-2 15:51:07

我也遇见过同样的问题，
可是modeller建模时，目标蛋白输入二聚体序列，置于模板A链匹配，也出现你这样的结果
请教一下，你是怎么解决的？

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