生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 3891|回复: 3

[药物设计] 关于三萜抗癌靶点的选择,谁能给点建议

[复制链接]
发表于 2013-2-1 23:18:36 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
大家好,我分到几个三萜细胞毒活性还行,是cycloartane triterpenoids类型的,有一个4.5umol/L左右,想找个抗癌靶点对接一下,但是没有找到合适的靶点,找了个同事,说cox-2的底物的活性构象和我的化合物很相似,都是链状的烷烃结构,但是用 gold对接了一下,打分很低,大家能不能给点建议,我该选择什么靶点,因为后期我们想研究这类化合物的作用靶点和机制,谢谢!
发表于 2013-2-2 15:19:43 | 显示全部楼层
用反向对接试试
发表于 2013-2-3 19:52:20 | 显示全部楼层
与ER的底物和某些抑制剂比较像。
如楼上所述,Reversed Docking可以试试(但是TarFisDock彻底残了)。另外有兴趣的话还可以试试SEA,PharmMapper或者ChemMapper,这些类似基于配体结构的靶标预测。
发表于 2013-2-16 22:42:48 | 显示全部楼层
1. 你获得的三萜是首分吗?
2. 个人觉得,可以先查查与你的化合物是否有类似结构,如果有的话,可以参看它们是什么靶点?当然,也不排除你的化合物作用其它靶点。
3. 反向对接的确是一种可选方法,重要的是看构象(管理员常对偶说的一句话哈哈)
供参考,好运!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3 )

GMT+8, 2024-11-17 21:33 , Processed in 0.050364 second(s), 20 queries .

Powered by Discuz! X3.4

Copyright © 2001-2020, Tencent Cloud.

快速回复 返回顶部 返回列表