关于三萜抗癌靶点的选择，谁能给点建议

wwwtony · 发表于 2013-2-1 23:18:36

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大家好，我分到几个三萜细胞毒活性还行，是cycloartane triterpenoids类型的，有一个4.5umol/L左右，想找个抗癌靶点对接一下，但是没有找到合适的靶点，找了个同事，说cox-2的底物的活性构象和我的化合物很相似，都是链状的烷烃结构，但是用 gold对接了一下，打分很低，大家能不能给点建议，我该选择什么靶点，因为后期我们想研究这类化合物的作用靶点和机制，谢谢！

北京-构效 · 发表于 2013-2-2 15:19:43

用反向对接试试

xxffliu · 发表于 2013-2-3 19:52:20

与ER的底物和某些抑制剂比较像。
如楼上所述，Reversed Docking可以试试（但是TarFisDock彻底残了）。另外有兴趣的话还可以试试SEA，PharmMapper或者ChemMapper，这些类似基于配体结构的靶标预测。

SYPHU_me · 发表于 2013-2-16 22:42:48

1. 你获得的三萜是首分吗？
2. 个人觉得，可以先查查与你的化合物是否有类似结构，如果有的话，可以参看它们是什么靶点？当然，也不排除你的化合物作用其它靶点。
3. 反向对接的确是一种可选方法，重要的是看构象（管理员常对偶说的一句话哈哈）
供参考，好运！

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