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[AutoDock&Vina] autodock的结果关于rmsd的意义

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发表于 2018-11-11 21:43:41 | 显示全部楼层 |阅读模式

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autodock中的cluster rmsd和reference rmsd分别代表的意义和区别,谁能代表对接的精度、重复性。
发表于 2018-11-14 12:32:24 | 显示全部楼层
Reference rmsd表示与参考分子(通常为晶体复合物中分子)对比的偏差。而Cluster 的rmsd是用于聚类分析,将对接出来的分子从构象上的差别进行分类。思考一下,就明白了。
 楼主| 发表于 2018-11-11 21:44:43 | 显示全部楼层
如这个dlg中的数据
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