求助：金属配合物怎么用DS做对接？其配位键该怎样处理？

nju-cat · 发表于 2018-4-8 16:03:17

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求助：金属配合物怎么用DS做对接？其配位键该怎样处理？谢谢

川大-灰太狼 · 发表于 2018-4-8 18:50:32

你可以查询一下DS中是否有处理金属配位键的对接模块，我知道德国BioSolveIT公司的LeadIT中的FlexX是有蛋白中金属离子配位键的考虑的。还有你的配体是络合物还是蛋白中的金属离子，这个你要先弄清楚。FlexX只适用于蛋白中的金属离子，不适合金属络合物。

nju-cat · 发表于 2018-4-8 19:14:15

川大-灰太狼发表于 2018-4-8 18:50
你可以查询一下DS中是否有处理金属配位键的对接模块，我知道德国BioSolveIT公司的LeadIT中的FlexX是有蛋白 ...

我这个应该是金属络合物吧

iovvoi · 发表于 2018-4-16 16:51:56

好久不来了，第一，你想做什么事情，是络合物的对接还是分子动力学，第一件事情确定后我再告诉你怎么做

nju-cat · 发表于 2018-4-16 17:31:52

iovvoi 发表于 2018-4-16 16:51
好久不来了，第一，你想做什么事情，是络合物的对接还是分子动力学，第一件事情确定后我再告诉你怎么做 ...

做分子对接

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