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[其他] 分子对接去除重复分子

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发表于 2013-1-16 20:40:42 | 显示全部楼层 |阅读模式

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我有一个化合物库,准备完成后每一个分子生成很多构象,然后进行对接打分。接着我想把每一个分子保留一个打分最高的,其它的重复分子去掉,请问我应该用什么软件,具体该怎么做呢?请高手指点
发表于 2013-1-17 08:27:44 | 显示全部楼层
估计也只有Pipeline pilot可以做了
 楼主| 发表于 2013-1-17 13:09:12 | 显示全部楼层
我用pipeline的Remove duplicate molecules ,只是去除了重复分子,但是不一定保留的是最佳对接分子构象啊,还应该怎么做呢,需要编个脚本什么的么
发表于 2013-1-17 17:06:15 | 显示全部楼层
你整个过程不就是一个分子对接的过程吗?而且还没有AD的LGA算法好!有必要这样做吗?
发表于 2013-4-23 09:32:53 | 显示全部楼层
编个脚本吧,遇到过同样的问题
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