autodock对接成功后，使用write complex导出结果，最后小分子构型出错！

花生花灭 · 发表于 2018-3-11 14:13:40

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autodock对接成功后，使用write complex导出结果，最后小分子构型出错！以前同样的操作没有出现过错误，不知道是什么情况，求解答！

白杨 · 发表于 2018-3-22 22:08:15

楼主能顺便截个图说一下具体是怎样的构型出错吗？

花生花灭 · 发表于 2018-3-23 17:20:26

白杨发表于 2018-3-22 22:08
楼主能顺便截个图说一下具体是怎样的构型出错吗？

[img][/img]

花生花灭 · 发表于 2018-3-23 17:23:34

@白杨如下图

花生花灭 · 发表于 2018-3-23 17:24:51

花生花灭发表于 2018-3-23 17:20
[/img]

看楼下

白杨 · 发表于 2018-4-7 23:43:13

花生花灭发表于 2018-3-23 17:23
@白杨如下图

导出complex前结构有出错吗？试试将分子和蛋白分开导出？

花生花灭 · 发表于 2018-4-8 15:52:34

在autodock 的Analyze里面看是没有错误。把大分子和蛋白分开导出怎么做？可能教下操作，如果将分子和蛋白分开导出，去取pymol看相互作用呢。

花生花灭 · 发表于 2018-4-8 15:53:37

白杨发表于 2018-4-7 23:43
导出complex前结构有出错吗？试试将分子和蛋白分开导出？

在autodock 的Analyze里面看是没有错误。把大分子和蛋白分开导出怎么做？可能教下操作，如果将分子和蛋白分开导出，怎么去pymol看相互作用呢。

乎am艾 · 发表于 2018-4-20 20:40:33

楼主，你的图片是怎样做出来的？求告知

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