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[Discovery Studio] 请问Discover studio的Docking结果如何用Pymol处理?

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发表于 2018-3-6 15:40:22 | 显示全部楼层 |阅读模式

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请问Discover studio的Docking结果如何用Pymol处理? 分子对接后的结果保存不了为PDB格式,但是Pymol由只能识别PDB等格式识别不了Discover studio自己的格式,求助去和解决用Pymol处理DS的对接结果。
 楼主| 发表于 2018-3-6 16:50:30 | 显示全部楼层
顶一下 有人知道吗?
发表于 2018-3-7 10:26:40 | 显示全部楼层
将对接后的分子放进蛋白中,选中蛋白与分子的复合物进行保存可以保存为PDB格式。PS:可以分享下你的DS安装包吗
 楼主| 发表于 2018-3-8 22:21:44 | 显示全部楼层
夕阳丶 发表于 2018-3-7 10:26
将对接后的分子放进蛋白中,选中蛋白与分子的复合物进行保存可以保存为PDB格式。PS:可以分享下你的DS安装 ...

我对接的就是蛋白和底物,请问这样也是将对接产物再放到没有对接的蛋白中去吗? DS给我邮箱 我可以发给你
 楼主| 发表于 2018-3-9 21:39:19 | 显示全部楼层
啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧
发表于 2018-3-19 19:37:22 | 显示全部楼层
不同软件间很难互相打开各自的文件,尤其是DS和别的软件连用,即使转换为SD等格式,切换时仍然容易出错。
把蛋白和小分子分别保存为pdb,然后再用别的软件打开进行合并处理吧,我常这么做
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