生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 8421|回复: 7

[Discovery Studio] 请问Discover studio的Docking结果如何用Pymol处理?

[复制链接]
发表于 2018-3-6 15:40:22 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
请问Discover studio的Docking结果如何用Pymol处理? 分子对接后的结果保存不了为PDB格式,但是Pymol由只能识别PDB等格式识别不了Discover studio自己的格式,求助去和解决用Pymol处理DS的对接结果。
 楼主| 发表于 2018-3-6 16:50:30 | 显示全部楼层
顶一下 有人知道吗?
发表于 2018-3-7 10:26:40 | 显示全部楼层
将对接后的分子放进蛋白中,选中蛋白与分子的复合物进行保存可以保存为PDB格式。PS:可以分享下你的DS安装包吗
 楼主| 发表于 2018-3-8 22:21:44 | 显示全部楼层
夕阳丶 发表于 2018-3-7 10:26
将对接后的分子放进蛋白中,选中蛋白与分子的复合物进行保存可以保存为PDB格式。PS:可以分享下你的DS安装 ...

我对接的就是蛋白和底物,请问这样也是将对接产物再放到没有对接的蛋白中去吗? DS给我邮箱 我可以发给你
 楼主| 发表于 2018-3-9 21:39:19 | 显示全部楼层
啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧啧
发表于 2018-3-19 19:37:22 | 显示全部楼层
不同软件间很难互相打开各自的文件,尤其是DS和别的软件连用,即使转换为SD等格式,切换时仍然容易出错。
把蛋白和小分子分别保存为pdb,然后再用别的软件打开进行合并处理吧,我常这么做
您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3 )

GMT+8, 2024-3-19 16:09 , Processed in 0.056894 second(s), 20 queries .

Powered by Discuz! X3.4

Copyright © 2001-2020, Tencent Cloud.

快速回复 返回顶部 返回列表