生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 382|回复: 4

小白一枚刚接触同源模建

[复制链接]
发表于 2017-10-16 13:06:41 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
本帖最后由 1598879010 于 2017-10-16 13:26 编辑

小白一枚刚接触同源模建,想模建的序列是NP-005682.2(NCBI),选用的模板是同源蛋白5TWV(PDB)。序列的一致性有63.2%。用的软件是discovery studio。同源模建中碰到一些问题:一是模板蛋白的TMD 2区域有6个跨膜螺旋,而我想模建的序列在这个区域只有4个跨膜螺旋,我不知道如何控制模建出来的蛋白在这个区域的螺旋数目;二是评价同源模建的RMSD值如何降低。。纯新人一个望大神解答
 楼主| 发表于 2017-10-16 13:07:59 | 显示全部楼层
666666666666666666
 楼主| 发表于 2017-10-16 13:15:47 | 显示全部楼层
66666666666666666666
 楼主| 发表于 2017-10-16 13:26:57 | 显示全部楼层
6666666666666666666
发表于 2017-10-16 13:45:09 | 显示全部楼层
好像没人回复你,,帮顶一下
您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3

GMT+8, 2018-6-25 10:27 , Processed in 0.165158 second(s), 27 queries .

Powered by Discuz! X3.3

© 2001-2017 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表