生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 647|回复: 2

[AutoDock&Vina] MGLTools 转换pdb文件报错

[复制链接]
发表于 2017-6-6 10:01:22 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
用MGLTools 中的prepare_ligand4.py处理ligand pdb文件时,总是报错“no Gasteiger parameters available”,你们有没有遇到过这种问题呢?求助解决方案,谢谢
发表于 2017-7-6 22:31:15 | 显示全部楼层
你导入你的结构以后,除了加氢,还要有一个计算点电荷 edit - charges - compute gasteiger这个过程,但是别问我为啥,我也是新手
发表于 2018-6-11 11:54:20 | 显示全部楼层
qq8942128 发表于 2017-7-6 22:31
你导入你的结构以后,除了加氢,还要有一个计算点电荷 edit - charges - compute gasteiger这个过程,但是 ...

我现在只知道是加氢,不明白为什么,能说一下加氢的原因吗?
您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3

GMT+8, 2018-12-17 07:17 , Processed in 0.097653 second(s), 26 queries .

Powered by Discuz! X3.3

© 2001-2017 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表