每个pdbid所代表的序列都不一样吗

liuxch5 · 发表于 2012-12-15 23:25:49

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每个pdbid所代表的序列都不一样吗

大工-阿里巴巴 · 发表于 2012-12-16 09:35:55

不是的~比如有些蛋白具有蛋白本身的结构，以及与底物共结晶的结构，这个时候两者有不同的PDB ID,但是对应的序列是一样的

西大-song · 发表于 2012-12-16 13:11:54

阿里说的很对，同一个蛋白结合不同的配体后会有不同的ID，一般来说，同一蛋白ID的前两位字母是一样的。比如，PDB里有三个1XJQ，1XNJ，1X6V就是同一个APS kinase结合了不同底物后的三个ID

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