生物分子模拟论坛

 找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 430|回复: 0

[提问] 分子对接结果分析

[复制链接]
发表于 2016-12-21 16:45:00 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?立即注册

x
本帖最后由 GottaGet 于 2016-12-21 16:59 编辑

各位好,我在使用pymol的过程中遇到一个问题,期待各位大神的解答,谢谢。

进行分子对接之后,用pymol显示了小分子的vdw surface和ele surface,这两个surface 又各自分为positive和negative两个小surface(如下图),导师让我分析,就是大概说明一下为什么在ele_pos surface周围引入电负性大的基团会使分子与周围氨基酸的静电作用增大等等。问题是用来与蛋白质对接的分子都不一样,但是它们的surface是完全一样的,想问一下这样是正确的吗?


截图19.jpeg
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3

GMT+8, 2017-12-12 20:03 , Processed in 0.211149 second(s), 31 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表