分子对接结果分析

GottaGet · 发表于 2016-12-21 16:45:00

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本帖最后由 GottaGet 于 2016-12-21 16:59 编辑

各位好，我在使用pymol的过程中遇到一个问题，期待各位大神的解答，谢谢。

进行分子对接之后，用pymol显示了小分子的vdw surface和ele surface，这两个surface 又各自分为positive和negative两个小surface（如下图），导师让我分析，就是大概说明一下为什么在ele_pos surface周围引入电负性大的基团会使分子与周围氨基酸的静电作用增大等等。问题是用来与蛋白质对接的分子都不一样，但是它们的surface是完全一样的，想问一下这样是正确的吗？

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[Pymol] 分子对接结果分析

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