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[其他] LeDock对接疑问-Docking一直为0%

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发表于 2016-11-9 15:19:17 | 显示全部楼层 |阅读模式

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捕获.PNG
此种情况是哪儿出了问题
发表于 2016-11-10 03:07:33 | 显示全部楼层
这个问题是因为读取配体Mol2文件出错。教程里面提供的对接案例在Xp、windows 7上测试都没有问题。也许是因为特定的解压缩文件造成配体Mol2文件改变有关系。

可以从zinc上随便下载一个小分子文件进行对接,看看能不能正常运行。

最好把你的lig.mol2文件上传一下,看看是不是文件有所改变。
 楼主| 发表于 2016-11-10 12:54:37 | 显示全部楼层
感谢版主的回复,昨天晚上把软件和案例拷到U盘换了个电脑和网络就没有问题了,所以我在怀疑是不是跟网速有关系,想咨询您下,整个docking过程需要网络吗?
 楼主| 发表于 2016-11-10 13:23:11 | 显示全部楼层
fireflying 发表于 2016-11-10 03:07
这个问题是因为读取配体Mol2文件出错。教程里面提供的对接案例在Xp、windows 7上测试都没有问题。也许是因 ...

原因已经找到了,可能是路径的问题,路径过长会导致Docking无法进行!
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