有关autodocktools 的parameter library-急求

淡然幸福9

急求各位大神帮忙解决下问题，我做的是含有Pt的配体与蛋白之间的docking，在run autogrid 时出现问题如下：
C:/Users/Administrator/Desktop/cisplatin/autogrid4.exe: ERROR:  unknown ligand atom type Pt
add parameters for it to the parameter library first!
我不知道parameter library在哪里，参数又是如何设置？感谢大家，急求答案。谢谢~！

温柔一刀5901

你是哪个课题组的，是郭子建老师那里的吗？我这有金属原子的参数，可以发给你

花生花灭

温柔一刀5901 发表于 2016-11-13 20:49
你是哪个课题组的，是郭子建老师那里的吗？我这有金属原子的参数，可以发给你 ...

可不可以教我改下金属原子的数据，我酶里面有金属原子不能识别，需要改数据，我不知道怎么操作，也没有原子数据。能否帮我下

viger87

花生花灭 发表于 2017-10-21 10:50
可不可以教我改下金属原子的数据，我酶里面有金属原子不能识别，需要改数据，我不知道怎么操作，也没有原 ...

Pt的参数：
atom_par Pt 2.75 0.080 12.000 -0.00110 0.0 0.0 0 -1 -1 1 # Non H-bonding
使用方法可以参考：
http://bioms.org/forum.php?mod=v ... 4%E5%AF%B9%E6%8E%A5