QSAR配体准备

chenglong_li · 发表于 2016-8-1 10:15:19

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有关QSAR的准备，笔者从PubChem数据库下载到了小分子配体的3D构象。现在的问题是：
对于已下载好的3D构象，还需要其它的哪些准备工作？
是否需要利用力场进行能量最优化操作？
是否需要进行加氢操作？
是否需要进行加电荷操作？
以及加氢加电荷时，通常选择何种电荷？
具体的操作步骤是什么？
多谢！
来自: 微社区

川大-灰太狼 · 发表于 2016-8-2 22:02:31

建议你先阅读sybyl的QSAR部分，再找几篇QSAR的文献一看就看明白了。

大工大-Chemoinf · 发表于 2016-12-13 11:54:46

做2D-QSAR还是3D-QSAR？2D的只需要SMILES也能做。

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[SYBYL] QSAR配体准备

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