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QSAR配体准备

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发表于 2016-8-1 10:15:19 来自手机 | 显示全部楼层 |阅读模式

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有关QSAR的准备,笔者从PubChem数据库下载到了小分子配体的3D构象。现在的问题是:
对于已下载好的3D构象,还需要其它的哪些准备工作?
是否需要利用力场进行能量最优化操作?
是否需要进行加氢操作?
是否需要进行加电荷操作?
以及加氢加电荷时,通常选择何种电荷?
具体的操作步骤是什么?
多谢!
来自: 微社区
发表于 2016-8-2 22:02:31 | 显示全部楼层
建议你先阅读sybyl的QSAR部分,再找几篇QSAR的文献一看就看明白了。
发表于 2016-12-13 11:54:46 | 显示全部楼层
做2D-QSAR还是3D-QSAR?2D的只需要SMILES也能做。
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