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[AutoDock&Vina] 新手使用autodock在运算autogrid中出现了问题

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发表于 2016-7-3 23:08:17 | 显示全部楼层 |阅读模式

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点击运算后出现如图 1111.png


求前辈指教~~
发表于 2016-7-8 10:59:34 | 显示全部楼层
HDH 发表于 2016-7-8 10:56
如果你是用的Win 版本的 Autodock,出现这个问题是因为 你的GPF文件里的gridfld及receptor及map 后面没有添 ...

红色部分是我自己的路径
GPF.PNG
发表于 2016-7-8 10:56:57 | 显示全部楼层
如果你是用的Win 版本的 Autodock,出现这个问题是因为 你的GPF文件里的gridfld及receptor及map 后面没有添加这些文件所在的路径 因为Win系统这个软件不能自己识别路径,需要你自己添加 你把这三项后面都添加上这些文件所在的路径载运行试试 我之前也出现过这个问题,就按我说的这种办法,现在解决了 给你附个图C:\GPF
 楼主| 发表于 2016-7-9 11:44:40 | 显示全部楼层
HDH 发表于 2016-7-8 10:56
如果你是用的Win 版本的 Autodock,出现这个问题是因为 你的GPF文件里的gridfld及receptor及map 后面没有添 ...

就是这个问题 现在解决了 谢谢前辈啊! 但是我到结果分析的时候 单击列表中的相应分子构象编号 就会出现python shell 双击也不会载入分子构想  如图 11111.jpg 请前辈指点呐
发表于 2016-7-4 09:27:17 | 显示全部楼层
复制一个autogrid4到运行目录下试试。
 楼主| 发表于 2016-7-5 09:42:44 | 显示全部楼层
hanlan8702 发表于 2016-7-4 09:27
复制一个autogrid4到运行目录下试试。

还是不行,  同样的提示
发表于 2016-7-5 17:49:54 | 显示全部楼层
初级小高手 发表于 2016-7-5 09:42
还是不行,  同样的提示

你设置工作的默认路径没?
 楼主| 发表于 2016-7-6 00:36:32 | 显示全部楼层
hanlan8702 发表于 2016-7-5 17:49
你设置工作的默认路径没?

您指的是这上面的路径吗? 都是正确的啊。 3333.jpg
发表于 2016-7-6 08:02:56 | 显示全部楼层
这个也设置了?这个设置了,就不用设置autogrid4的路径。
Screenshot from 2016-07-06 08:01:29.png
发表于 2016-7-6 09:42:51 | 显示全部楼层
文件名 不要有空格,包括文件夹的名字
 楼主| 发表于 2016-7-6 14:19:06 | 显示全部楼层
prince好先森 发表于 2016-7-6 09:42
文件名 不要有空格,包括文件夹的名字

我把空格去掉之后又出现这种 4444.jpg ,什么情况呀
 楼主| 发表于 2016-7-6 14:28:46 | 显示全部楼层
hanlan8702 发表于 2016-7-6 08:02
这个也设置了?这个设置了,就不用设置autogrid4的路径。

现在出现了这个 5555.jpg 感觉好难啊。
发表于 2016-7-6 15:33:05 | 显示全部楼层
1cvl.pdbqt文件路径对吗?有没有这个文件这个文件夹里面
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