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[AutoDock&Vina] 怎么将autodock的结果修饰一下

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发表于 2016-6-13 21:31:04 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本帖最后由 Alecia 于 2016-6-13 21:33 编辑

亲们,我在用autodock作对接时,遇到的问题有:1、得到的是能量这么高,这样的结果能用吗?2、做出来的图的怎么修饰一下啊,感觉我现在得到的结果图不能直接用在文章里。急用,求各位指导一下!

autodock 结果图

autodock 结果图

能量图

能量图
 楼主| 发表于 2016-6-13 21:54:56 | 显示全部楼层
autodock能做多聚体蛋白和单蛋白的对接吗?
发表于 2016-6-15 15:25:50 | 显示全部楼层
1、得到的结果能量太高,请检查分子的体积与蛋白活性空腔的体积大小是否匹配。
2、可以使用pymol,Yasara view,chmeria、VMD等作图软件进行作图。
发表于 2016-6-15 15:26:12 | 显示全部楼层
Alecia 发表于 2016-6-13 21:54
autodock能做多聚体蛋白和单蛋白的对接吗?

autodock目前还不能用于蛋白-蛋白对接。
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