autodock处理小分子断键

半里格 · 发表于 2016-4-25 11:35:28

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使用autodock处理小分子后，由最开始的pdb保存为pdbqt格式，三氮唑环竟然开环了，请问是什么原因，纠结了好多天，望大神们帮帮忙！

川大-灰太狼 · 发表于 2016-4-26 20:29:50

小分子不适合用pdb格式，最好使用mol2格式。

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[AutoDock&Vina] autodock处理小分子断键