vina对接之后在pymol显示的脚本有谁知道~~~求助

yangyeryer · 发表于 2016-3-15 10:36:01

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vina对接好了，出现out.pdbqt文件，用pymol打开，只有小分子在，请问怎么显示出蛋白，前两天刚用，忘记在哪里找到了脚本直接在pymol里输入后显示蛋白，有谁有那个脚本吗，win7系统的

WLQ · 发表于 2016-3-16 09:48:24

同问，有没有公司可以收费开发这样的脚本？

lrf1980 · 发表于 2016-3-17 16:31:12

为什么要用脚本，直接用pymol打开蛋白质的pdb文件，或者pdbqt文件不就可以了么？

川大-灰太狼 · 发表于 2016-3-17 22:19:52

直接导入蛋白，导入out.pdbqt，这样就好了：）

yangyeryer · 发表于 2016-4-15 09:21:29

lrf1980 发表于 2016-3-17 16:31
为什么要用脚本，直接用pymol打开蛋白质的pdb文件，或者pdbqt文件不就可以了么？ ...

想让蛋白显示成折叠螺旋样子，pdbqt显示不成这样的形式

yangyeryer · 发表于 2016-4-15 09:22:57

川大-灰太狼发表于 2016-3-17 22:19
直接导入蛋白，导入out.pdbqt，这样就好了：）

怎么使蛋白显示cartoon形式，pdbqt显示不了

zxc1984 · 发表于 2016-4-15 17:48:34

pymol里，点show，有个as选项，选中cartoon就可以了

yangyeryer · 发表于 2016-4-18 10:42:12

zxc1984 发表于 2016-4-15 17:48
pymol里，点show，有个as选项，选中cartoon就可以了

pdbqt的格式显示不了

zxc1984 · 发表于 2016-4-18 17:05:53

yangyeryer 发表于 2016-4-18 10:42
pdbqt的格式显示不了

File--Open--选择你对接时用的蛋白的PDB或者PDBQT文件即可

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