用DS进行分子对接时,怎样计算RMSD?

wenfony · 发表于 2016-3-2 16:05:57

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各位大神，用DS进行分子对接时，现将下载的靶点蛋白中所含配体拿出来，然后对接回去，怎样计算对接后配体的构象与原始晶体中配体构象的RMSD?

zhad33 · 发表于 2016-4-13 16:12:47

先选中晶体的分子，点structrue/RMSD/set refencen，再选全部分子，点structure/rmsd/Heavy atoms，就可以了

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