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[AutoDock&Vina] Autodock分子对接问题请教

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发表于 2016-2-23 17:24:46 | 显示全部楼层 |阅读模式

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要对接的蛋白质含有辅酶磷酸吡哆醛(PLP),首先需要PLP与蛋白质中的lys180残基形成共价键,然后再和底物对接,请教在autodock中该怎样设定使lys与PLP形成共价键?谢谢!
发表于 2016-2-23 23:02:54 | 显示全部楼层
autodock无法做这个共价键的对接,这个需要使用其他对接软件进行,比如gold,glide商业软件,免费的roseeta fitted covlentdock,还有一些免费的网站可以进行。
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