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[Dock] Dock活性位点不确定的对接

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发表于 2016-1-20 15:29:54 | 显示全部楼层 |阅读模式

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在蛋白质与抑制剂对接时,从文献中得知结合部位的大致位置(某几个氨基酸附近),在对接时用最大簇,对接后的位置与文献中的位置不一样,是不是要换其他簇?
还有就是之前可以用RMSD来衡量对接部位的好坏,这里没有原配体作参照,就不能用RMSD,那是否可以用其他的参数来衡量对接的好坏?
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