请问docking后，我想要计算RMSD值，

fenziduijie · 发表于 2015-12-6 16:30:33

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请问docking后，我想要计算RMSD值，可是我的配体跟蛋白晶体里面的配体结构差别比较大，那是不是不适合计算RMSD值？
然后还有什么其他的方法评估我docking的结果呢？

刚来，没啥积分

fenziduijie · 发表于 2015-12-6 16:31:03

大神快来

川大-灰太狼 · 发表于 2016-4-6 21:39:59

对接的结果主要是参考原来已有的配体的相互作用，然后做比较分析，RMSD只是一种评价方法，主要评价的也是同一个配体对接后的差别。

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[AutoDock&Vina] 请问docking后，我想要计算RMSD值，