小分子文件in格式

浙医-中药筛选 · 发表于 2015-11-25 10:10:20

马上注册，结交更多好友，下载更多分子模拟资源。

您需要登录才可以下载或查看，没有帐号？我想注册

x

各位大侠，本人准备做中药虚拟筛选，中药小分子库是从ZINC库中Natural Products中下载的，一共有57423个化合物，如图所示，这是一个 .in格式的文件。但本人却不知道如何打开? 我已经用过DSV，openbabel等软件，网上也查了查，还是没有弄懂。请了解的大侠指点指点，这个格式该如何打开？谢谢！

pesticide_ccnu · 发表于 2015-11-25 13:53:06

分子分子库总体来说都是结构文件可以用vi或者写字本打开来

pesticide_ccnu · 发表于 2015-11-25 13:53:53

分子分子库总体来说都是结构文件可以用vi或者写字本打开来不过你这个估计是一个下载的脚本具体的你打开看就知道了

浙医-中药筛选 · 发表于 2015-11-25 19:28:46

感谢pesticide_ccnu。这分子库是可以用记事本打开的，里面分别一行一行列着结构式。但是我碰到困难是这个文件该如何直接转换成化学结构的pdb, sdf，mol等格式，这样可以在DSV，pymol等软件中可以查看? 谢谢

浙医-中药筛选 · 发表于 2015-12-1 08:35:40

问题解决。下载文件的时候应该是点击图中SDF，或Mol2。则下载.bat 文件。用记事本打开，将里面的下载链接拷贝到迅雷就可以下载了。记事本中下载链接说明如图所示（截取小木虫论坛 http://emuch.net/html/201309/6396400.html）。以上与新手们分享！

帐号		自动登录	找回密码
密码			我想注册

[药物设计] 小分子文件in格式

马上注册，结交更多好友，下载更多分子模拟资源。