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[YASARA] 底物与酶催化中心的距离测定

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发表于 2015-10-26 11:05:32 | 显示全部楼层 |阅读模式

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    各位前辈大家好,在下刚涉及到分子模拟领域,请问大家做分子模拟时,使用yasara,底物与酶催化中心的距离测定能测出来吗,或者别的模拟软件。求大神指教,不胜感激。
发表于 2015-10-27 10:30:42 | 显示全部楼层
这个很多软件都可以实现,pymol, DS...
发表于 2015-10-27 12:20:01 | 显示全部楼层
就是量距离呗
你看看yasara的用户手册,肯定有
 楼主| 发表于 2015-10-29 09:56:31 | 显示全部楼层
greatzdl 发表于 2015-10-27 12:20
就是量距离呗
你看看yasara的用户手册,肯定有

你好,问题是量的底物与酶活性中心的距离,底物用什么建模比较好,测量距离时,除了yasara view,还会用到其他模块吗,求前辈指教,不胜感激。
 楼主| 发表于 2015-10-29 10:00:55 | 显示全部楼层
肖云天 发表于 2015-10-27 10:30
这个很多软件都可以实现,pymol, DS...

你好,pymol, DS,其中pymol安装了,好像用着不是很方便,我安装的是1.7版本的,麻烦您能给在下一个较详细的操作步骤吗,底物怎样建模比较好,十分感谢,
发表于 2015-11-3 16:51:18 | 显示全部楼层
上官爵 发表于 2015-10-29 10:00
你好,pymol, DS,其中pymol安装了,好像用着不是很方便,我安装的是1.7版本的,麻烦您能给在下一个较详 ...

pymol是经典可视化软件呀,作图神器,怎么会不方便呢?
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