请问在swiss-model网站得到的模拟结构怎么在pymol中形成symmetry mates

breaker · 发表于 2015-10-14 08:36:57

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请问在swiss-model网站得到的模拟结构怎么在pymol中形成symmetry mates ？总是显示no symmetry loaded.是不是模拟的蛋白缺失了一些信息吗？请问怎么解决。谢谢！

breaker · 发表于 2015-10-15 00:21:46

greatzdl 发表于 2015-10-14 20:18
那你把方案贴出来呗

我想做三聚体，建模后的文件是单体，在pymol中复制两个单体。加载模版文件，模板文件可以生存symmetry mates三聚体。然后用align命令将自己的三个单体与模板的三聚体进行比对，就形成自己想要的三聚体结构了。

breaker · 发表于 2015-10-14 09:25:07

请大神帮忙，在线等。谢谢啦。

greatzdl · 发表于 2015-10-14 09:46:26

本帖最后由 greatzdl 于 2015-10-14 09:48 编辑

A（action）---》generate---》symmetry mate第一个问题
第二个就不明白了

breaker · 发表于 2015-10-14 09:59:03

greatzdl 发表于 2015-10-14 09:46
A（action）---》generate---》symmetry mate第一个问题
第二个就不明白了

wo做了，但是总是显示no symmetry load. 然后我在chimera里查看的时候没有space group, cell size, cell angle等信息。但是晶体结构的pdb都有这些信息，也能形成symmetry mates。所以我想是不是因为modelling的结构无法形成symmetry mates？

greatzdl · 发表于 2015-10-14 13:25:48

breaker 发表于 2015-10-14 09:59
wo做了，但是总是显示no symmetry load. 然后我在chimera里查看的时候没有space group, cell size, cell ...

有可能
但我也不知道到如何解决

breaker · 发表于 2015-10-14 14:24:05

greatzdl 发表于 2015-10-14 13:25
有可能
但我也不知道到如何解决

已经解决了，谢谢回复

greatzdl · 发表于 2015-10-14 20:18:08

breaker 发表于 2015-10-14 14:24
已经解决了，谢谢回复

那你把方案贴出来呗

程述震 · 发表于 2019-7-4 09:54:05

您好，请问您的问题是怎么解决的，谢谢啦，chengshuzhen0828@gmail.com

娜娜 · 发表于 2019-12-30 13:19:14

同求解决方法，2930740369@qq.com

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[Pymol] 请问在swiss-model网站得到的模拟结构怎么在pymol中形成symmetry mates

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