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[AutoDock&Vina] autodock时没运行成功 也没提示任何错误?

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发表于 2015-10-13 10:27:56 | 显示全部楼层 |阅读模式

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autodock时没显示successful completion 也没提示任何错误,对话框一直都在运行中,都运行一晚上了。。。。但是产生的.dlg文件没有10个构像,这是怎么回事?求指教,谢谢啦
发表于 2015-10-16 10:23:50 | 显示全部楼层
什么系统下运行的?准备的材料是否都放到了一个文件夹?如果是windows下面,最好用dos命令窗口运行,这样可以看到报错的提示。
发表于 2015-10-21 10:20:24 | 显示全部楼层
川大-灰太狼 发表于 2015-10-16 10:23
什么系统下运行的?准备的材料是否都放到了一个文件夹?如果是windows下面,最好用dos命令窗口运行,这样可 ...


                               
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运行autodock没成功,提示是“

                               
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”是怎么回事啊?请求回复,谢谢{:soso_e183:}
发表于 2015-11-7 15:14:39 | 显示全部楼层
第一次用autodock,做这个经典对接的时候,在File->Save->Wriete PDB 保存修改过得receptor分子的时候保存不了,求帮助
出现如下提示:
Python 2.5.6 (r256:88840, Nov  6 2012, 15:29:26)
[GCC 4.1.2 20061115 (prerelease) (Debian 4.1.1-21)] on linux2
Type "copyright", "credits" or "license()" for more information.

    ****************************************************************
    Personal firewall software may warn about the connection IDLE
    makes to its subprocess using this computer's internal loopback
    interface.  This connection is not visible on any external
    interface and no data is sent to or received from the Internet.
    ****************************************************************
   
IDLE 1.2.6      ==== No Subprocess ====
>>> Exception in Tkinter callback
Traceback (most recent call last):
  File "/home/zsx/下载/mgltools/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1414, in __call__
    return self.func(*args)
  File "/home/zsx/下载/mgltools/MGLToolsPckgs/Pmv/fileCommands.py", line 1783, in guiCallback
    self.defaultFilename = os.path.join(currentPath,self.mol.name) + '.pdb'
  File "/home/zsx/下载/mgltools/lib/python2.5/posixpath.py", line 65, in join
    path += '/' + b
UnicodeDecodeError: 'ascii' codec can't decode byte 0xe4 in position 10: ordinal not in range(128)
 楼主| 发表于 2015-11-8 20:49:36 | 显示全部楼层
韩小寒qqq 发表于 2015-10-21 10:20
运行autodock没成功,提示是“”是怎么回事啊?请求回复,谢谢

已解决,谢谢你啊
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