对接成功后如何变为一个pdb 文件？谢!

有效提取 · 发表于 2015-8-23 15:04:47

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对接成功后如何变为一个pdb 文件？谢!

有效提取 · 发表于 2015-8-23 15:05:33

autodock 对接成功后如何变为一个pdb 文件？谢!

nnxqwei · 发表于 2016-6-20 12:16:27

对接成功后，加入原来的受体，在“set play options"对话框下选择"write complex"将把“配体+受体”文件保存为.pdbqt格式的文件（若直接保存为pdb格式的，再用其它软件pymol开打是会结构会异常，因为带电荷）；将.pdbqt文件再用Autodock打开，再保存File>Save>Write PDB即得到正常结构的对接好的结构了。

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