结果可视化软件YASARA View 2015年3月最新版

川大-灰太狼

YASARA View 15.3.8 2015年3月最新版，欢迎大家下载！
http://www.moldesigner.com/?p=959

YASARA View: 基本的可视化模块，是一个完全免费的模块。

YASARA View免费下载和使用，其包含所有你需要研究大分子结构的功能。同时，你将获得YASARA先进的3D可视化界面，这比你所知的OpenGL的速度高达10倍（见基准），你能同时加载多个结构，制作高质量图片，包括标签，并编程自己的macros和Python插件。YASARA中含有多媒体演示和高阶教程的YASARA Movie，以及YASARA Python模块。

主要特征：

•跨平台，易于安装：Windows，Linux和Mac OS X均在同一个目录下，可直接从USB上运行。
•全屏生动形象的分子图片：比OpenGL处理高达10倍，甚至在CPK模式下核糖体也能顺利旋转。支持最新GPU着色器的功能，如硬件曲面细分，即GPU可增加多边形网格的空间细节（例如表面和二级结构）。
•平行（交互）和透视投影。
•交互式盒子，手形/套锁或球形选择原则工具。
•支持70余种分子文件（基于OpenBabel）。
•可从RCSB或PDB_REDO中下载PDB文件。
•由于实时阴影和环境照明，从而拥有最佳深度感知，即使在旧的硬件设施上。
•所有常见的图形模式：CPK, balls & sticks, sticks, traces, tubes, ribbons, cartoons, labels, arrows。
•交互的二级结构变形器，可在现实（接近Caipha）和理想化二级结构显示中完美插入，还被设置以无数种显示方式来匹配你最喜欢的二级结构造型。
•Ray-tracing确保任意分辨率的图像其出版质量，可交互移动光源，调整阴影。
•可在顺序保证和质量指示下改变任何PDB文件的颜色（DSSP/PDB Finder2自动绘制）。
•叠合结构和结构系综，计算出适当的RMSDs。
•根据多种方法对蛋白质的结构和序列进行匹配，并在PDB中自动识别相关结构。
•测量距离，角度，二面角。
•建立原子，残基，肽链和突变氨基酸。
•可视化接触，氢键，和疏水/π-π/阳离子-π相互作用。
•从无到有，创立形象的3D结构，或1D、2D分子，以及把它们转化回2D结构式。
•自动分配键长和丢失的氢原子。
•分析和改变原子的B-factors和占有率，重命名和编号原子和残基。
•极速算法实时显示和更新范德华力，分子和溶剂可及表面。
•使用Python脚本语言来扩展YASARA功能。
•通过Python脚本运行YASARA，如’import yasara’。
•简单的Yanacondamacro语言可将你的工作自动化，灵活操作。
•电子学习功能：互动式教程提供了有关分子结构，建模和模拟的知识。

下载地址：http://kuai.xunlei.com/d/NlJKBTQWtA5TVQQA203

tjpugu

请问免费的YASARA View中得到的数据可以直接用于论文而不涉及版权问题吗？

syjohn

如果想普及的话，最好有相关的教程，因为现在很多成熟的软件都有基本的教程，这样也可以使很多人很快的上手

川大-灰太狼

tjpugu 发表于 2015-12-28 20:26
请问免费的YASARA View中得到的数据可以直接用于论文而不涉及版权问题吗？

免费的yasara view的数据可以直接用于论文，注意引用即可！

kangsgo

灰太狼能不能更新一下连接，迅雷快传已经不可用了

阿尔的太阳0

链接不能下载了