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[其他] 关于酶活性位点的叠加

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发表于 2015-3-31 17:06:07 | 显示全部楼层 |阅读模式

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最近小弟刚接到一个课题,有A,B,C三类酶,需要设计一个小分子对他们同时起作用,按老师的要求需要先将三类酶的活性位点叠加,然后再对接,但是我不知道该怎么弄,希望大家能帮帮我
发表于 2015-3-31 23:53:22 | 显示全部楼层
可以试试先叠合蛋白,用yasara view或者pymol免费的可视化软件。
 楼主| 发表于 2015-4-1 13:18:39 | 显示全部楼层
川大-灰太狼 发表于 2015-3-31 23:53
可以试试先叠合蛋白,用yasara view或者pymol免费的可视化软件。

最近在学DS和Sybyl,不知道这两个可不可以使活性位点叠加,感觉好盲目啊
发表于 2015-4-1 14:37:48 | 显示全部楼层
含笑半步颠 发表于 2015-4-1 13:18
最近在学DS和Sybyl,不知道这两个可不可以使活性位点叠加,感觉好盲目啊

这两个也可以,在他们的蛋白处理里面,只是他们的作图效果不如YASARA View和Pymol。
 楼主| 发表于 2015-4-1 16:24:26 | 显示全部楼层
川大-灰太狼 发表于 2015-4-1 14:37
这两个也可以,在他们的蛋白处理里面,只是他们的作图效果不如YASARA View和Pymol。 ...

好吧,不知道大侠有没有处理蛋白的教程?
发表于 2015-4-1 22:34:57 | 显示全部楼层
含笑半步颠 发表于 2015-4-1 16:24
好吧,不知道大侠有没有处理蛋白的教程?

可以去我们论坛的的Pymol版面或者yasara 版面,有学习的教程。
align 命令
 楼主| 发表于 2015-4-2 08:31:24 | 显示全部楼层
川大-灰太狼 发表于 2015-4-1 22:34
可以去我们论坛的的Pymol版面或者yasara 版面,有学习的教程。
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好的,非常感谢,最后一个问题,用DS和Sybyl的哪个板块可以处理蛋白啊?
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