关于酶活性位点的叠加

含笑半步颠 · 发表于 2015-3-31 17:06:07

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最近小弟刚接到一个课题，有A,B,C三类酶，需要设计一个小分子对他们同时起作用，按老师的要求需要先将三类酶的活性位点叠加，然后再对接，但是我不知道该怎么弄，希望大家能帮帮我

川大-灰太狼 · 发表于 2015-3-31 23:53:22

可以试试先叠合蛋白，用yasara view或者pymol免费的可视化软件。

含笑半步颠 · 发表于 2015-4-1 13:18:39

川大-灰太狼发表于 2015-3-31 23:53
可以试试先叠合蛋白，用yasara view或者pymol免费的可视化软件。

最近在学DS和Sybyl，不知道这两个可不可以使活性位点叠加，感觉好盲目啊

川大-灰太狼 · 发表于 2015-4-1 14:37:48

含笑半步颠发表于 2015-4-1 13:18
最近在学DS和Sybyl，不知道这两个可不可以使活性位点叠加，感觉好盲目啊

这两个也可以，在他们的蛋白处理里面，只是他们的作图效果不如YASARA View和Pymol。

含笑半步颠 · 发表于 2015-4-1 16:24:26

川大-灰太狼发表于 2015-4-1 14:37
这两个也可以，在他们的蛋白处理里面，只是他们的作图效果不如YASARA View和Pymol。 ...

好吧，不知道大侠有没有处理蛋白的教程？

川大-灰太狼 · 发表于 2015-4-1 22:34:57

含笑半步颠发表于 2015-4-1 16:24
好吧，不知道大侠有没有处理蛋白的教程？

可以去我们论坛的的Pymol版面或者yasara 版面，有学习的教程。
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含笑半步颠 · 发表于 2015-4-2 08:31:24

川大-灰太狼发表于 2015-4-1 22:34
可以去我们论坛的的Pymol版面或者yasara 版面，有学习的教程。
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好的，非常感谢，最后一个问题，用DS和Sybyl的哪个板块可以处理蛋白啊？

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