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[AutoDock&Vina] autodock运行docking程序时一直无法完成运行

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发表于 2015-3-24 21:04:10 | 显示全部楼层 |阅读模式

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    本人刚开始学autodock,熟悉了软件之后是按着教程一步一步做1HSG的例子,先grid再dock的,前面所有操作跟教程一模一样,grid也能正常运行,但是到运行dock的时候,运行了几个小时一直没有运行完成。后来索性强制关了界面,查看dock的记录日志ind.dlg文件,发现显示错误:eval.cc:  ERROR!  energy is infinite!(能量无穷大)
    我按着教程重做了三遍,还是出现同样的错误!{:soso_e127:}
QQ图片20150324215522.png
eval.cc:  ERROR!  energy is infinite!(能量无穷大)   
    跪求大神帮忙解决问题!!!O(∩_∩)O谢谢



发表于 2015-3-26 14:12:52 | 显示全部楼层

回帖奖励 +2 金币

首先将dimensions设定为50,50,50试试。如果还是错误的话,检查下蛋白质是否完整,原子间crash等问题。
 楼主| 发表于 2015-3-27 11:19:54 | 显示全部楼层
墨竹晓风 发表于 2015-3-26 14:12
首先将dimensions设定为50,50,50试试。如果还是错误的话,检查下蛋白质是否完整,原子间crash等问题。 ...

调整了grid的尺寸,果然很顺利解决了问题!O(∩_∩)O谢谢大神指点!
发表于 2015-3-30 17:08:38 | 显示全部楼层
背包旅客 发表于 2015-3-27 11:19
调整了grid的尺寸,果然很顺利解决了问题!O(∩_∩)O谢谢大神指点!

不客气,加油!
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